EvoMorph - Evolution & Morphogenèse dans les systèmes moléculaires

Membres permanents : Jean-Christophe Galas, Clément Nizak.
Non-permanents : Angelo Charry, Romain Leroux, Nicolas Lobato-Dauzier, Matilde Pattanaro, Amaury Paveyranne.

Dans le groupe EvoMorph, nous utilisons et développons des modèles expérimentaux pour aborder des questions fondamentales liées à la morphogenèse et à l'évolution.

Nos modèles expérimentaux reposent sur l'ADN, les enzymes, les anticorps ou encore des protéines du cytosquelette. Nous sommes familiers avec la microscopie à fluorescence, le séquençage d'ADN à haut débit, la PCR, la microfluidique en gouttes...

L'axe Evolution est supervisé par Clément Nizak, l'axe Morphogenèse par Jean-Christophe Galas et André Estévez-Torres. Les liens ci-dessous fournissent plus d'informations sur ces deux axes.


Evolution Morphogenèse

Doctorants (soutenance 2018->)

  • 2026 Romain Leroux
  • 2023 Guillaume Sarfati
  • 2020 Anis Senoussi

Post-docs

  • 2023-… Gwenael Bonfante
  • 2023-… Baptiste Blanc
  • 2022-… Nicolas Lobato-Dauzier,
  • 2017-2022 Marc Van Der Hofstadt
  • 2019-2021 Yuliia Vyborna
  • 2017-2019 Georg Urtel
  • 2018-2019 Shunichi Kashida

Stagiaires Master

Master 1:

  • 2023 Chloé Dal Degan  
  • 2021 Dimitri Roueff  
  • 2020 Jeanne Bauduin

Master 2:

  • 2021 Léo Faure
  • 2021 Théophile Seck
  • 2019 Clara del Junco
  • 2018 Aina Ramamonjy
  • 2018 Moencopi Bernheim-Dennery

Publications

2024

⊞ Collective chemomechanical oscillations in active hydrogels - PNAS (Feb. 2024)
B. Blanc , J. Agyapong, , I. Hunter, , J.C. Galas , A. Fernandes-Nieves, , S. Fraden
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1073/pnas.2313258121

2022

⊞ Crosslinking and depletion determine spatial instabilities in cytoskeletal active matter - Soft Matter (May. 2022)
G. Sarfati , A. Maitra , R. Voituriez , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1039/D2SM00130F
⊞ Long-Lasting and Responsive DNA/Enzyme-Based Programs in Serum-Supplemented Extracellular Media - ACS Synthetic Biology (Feb. 2022)
J.C. Galas , A. Estevez-Torres , M. Van Der Hofstadt Serrano
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1021/acssynbio.1c00583
⊞ Front speed and pattern selection of a propagating chemical front in an active fluid - Physical Review E (Jan. 2022)
C. del Junco , A. Estevez-Torres , A. Maitra
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1103/PhysRevE.105.014602

2021

⊞ Programmed mechano-chemical coupling in reaction-diffusion active matter - Science Advances (Dec. 2021)
A. Senoussi , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1126/sciadv.abi9865
⊞ DNA-Controlled Spatiotemporal Patterning of a Cytoskeletal Active Gel - JACS (Nov. 2021)
Y. Vyborna , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1021/jacs.1c06730
⊞ Learning from Embryo Development to Engineer Self-organizing Materials - Out-of-Equilibrium (Supra)molecular Systems and Materials (Apr. 2021)
A. Senoussi , Y. Vyborna , H. Berthoumieux , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
⊞ Programming Spatio-temporal Patterns with DNA-based Circuits - Wiley (publisher) DNA- and RNA-Based Computing Systems (Jan. 2021)
M. Van Der Hofstadt Serrano , G. Gines , J.C. Galas , A. Estevez-Torres

2020

⊞ Spatiotemporal Patterning of Living Cells with Extracellular DNA Programs - ACS Nano (Dec. 2020)
M. Van Der Hofstadt Serrano , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1021/acsnano.0c09422

2019

⊞ DNA-based long-lived reaction-diffusion patterning in a host hydrogel - Soft Matter (Oct. 2019)
G. Urtel , A. Estevez-Torres , J.C. Galas
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1039/C9SM01786K
⊞ Tunable corrugated patterns in an active nematic sheet - PNAS (Oct. 2019)
A. Senoussi , S. Kashida , R. Voituriez , J.C. Galas , A. Maitra , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1073/pnas.1912223116
⊞ rEXPAR: An Isothermal Amplification Scheme That Is Robust to Autocatalytic Parasites - Biochemistry (Jun. 2019)
G. Urtel , M. Van Der Hofstadt Serrano , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1021/acs.biochem.9b00063

2018

⊞ Quantitative Characterization of Translational Riboregulators Using an in Vitro Transcription-Translation System - ACS Synth. Biol. (Apr. 2018)
A. Senoussi , J. Lee Tin Wah , Y. Shimizu , J. Robert , A. Jaramillo , S. Findeiss , I. M. Axmann , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1021/acssynbio.7b00387

2017

⊞ Synthesis and materialization of a reaction-diffusion French flag pattern - Nature chem. (May. 2017)
A. Zadorin , Y. Rondelez , G. Gines , V. Dilhas , G. Urtel , A. Zambrano , J.C. Galas , A. Estevez-Torres
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1038/nchem.2770
⊞ Microscopic agents programmed by DNA circuits - Nature Nano (Jan. 2017)
G. Gines , A.S. Zadorin , J.C. Galas , T. Fujii , A. Estevez-Torres , Y. Rondelez
  URL Full text PDF Bibtex doi:10.1038/nnano.2016.299