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Soutenance de thèse de Florence Bansept
05
DÉC 2018

Florence Bansept a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse qui aura lieu le mercedi 5 décembre à 10h à l'amphithéâtre Charpak (niveau SB, au pied de la tour 22, 4 place Jussieu, Paris 5ème), où elle présentera ses travaux portant sur la

Modélisation biophysique des dynamiques d'une population bactérienne et de la réponse immunitaire dans les intestins

ainsi qu'au pot qui suivra en salle de séminaires du Laboratoire Jean Perrin (tour 32-33, 5ème étage).

La soutenance aura lieu en anglais devant un jury composé de :

- M. Raphaël Voituriez, Directeur de thèse
- M. Bahram Houchmandzadeh, Rapporteur
- Mme. Agnese Seminara, Rapportrice
- Mme. Aleksandra Walczak, Examinatrice
- Mme. Silvia De Monte, Examinatrice
- M. Andrea Parmeggiani, Examinateur
- Mme. Emma Wetter-Slack, Invitée
- Mme. Claude Loverdo, Invitée

 

Résumé

La première partie de cette thèse porte sur les dynamiques de colonisation d'une population bactérienne au début d'une infection intestinale. Le but est de déduire des paramètres biologiquement pertinents de données indirectes. Un modèle simple est étudié, et l'on discute de l'observable optimale pour caractériser la variabilité d'une distribution d'étiquettes génétiques. Des arguments biologiques et des incohérences entre des observables expérimentales avec le premier modèle motivent l'étude d'un second, où deux sous-populations se répliquent à des taux différents, mais on ne peut pas conclure clairement sur le jeu de données utilisé.

La seconde partie porte sur les mécanismes de la réponse immunitaire. Le principal effecteur du système immunitaire adaptatif dans l'intestin, l'IgA (un anticorps), enchaîne les bactéries-filles en agrégats clonaux lors de la réplication. Nous avons contribué à prouver ce phénomène par un modèle qui prédit la réduction de la diversité bactérienne qui en découle. Au sein de l'hôte, l'interaction entre la croissance et la fragmentation des agrégats a pour conséquence le piégeage préférentiel des bactéries à croissance rapide, ce qui pourrait permettre au système immunitaire de réguler la composition du microbiote. A l'échelle de la population-hôte, et dans le contexte de l'évolution d'une résistance aux antibiotiques, si les bactéries sont transmises sous forme d'amas clonaux, alors la probabilité de transmettre une bactérie résistante est réduite dans une population immunisée. Ainsi, des outils de physique statistique nous permettent d'identifier des mécanismes génériques en biologie.